Guillaume Flavigny grandit auprès d'un père passionné de musique, et il parle encore de ses formules en termes musicaux. Il étudie la chimie, passe de 1998 à 2000 à l'ISIPCA puis se forme à l'école de parfumerie Givaudan jusqu'en 2003. En 2002, alors encore étudiant, il remporte le prix international des jeunes parfumeurs. Il rejoint l'équipe parisienne de Givaudan, passe deux ans sous la direction d'Antoine Lie, puis travaille plus tard à New York.
Il ne voit aucune opposition entre naturels et synthétiques, et se tourne vers ces derniers pour une ligne moderne ou davantage de tenue. On lui doit, entre autres, Ambre Gris pour Balmain (2008) et Black pour Comme des Garçons (2013), jusqu'à White Tea pour Elizabeth Arden (2017), Rose Prick pour Tom Ford (2020) et L'Eau Rêvée d'Isa pour Sisley (2023). Il travaille sur Uomo Born in Roma pour Valentino (2019), partage Signature pour Montblanc (2020) avec Natalie Gracia-Cetto, et signe Max Richter 01 pour Comme des Garçons en 2025.
The Harmonist, fondée en 2015 et installée à Paris et à Los Angeles, bâtit sa collection de lancement sur cinq éléments, la terre, l'eau, le bois, le feu et le métal, chacun décliné en version yin et yang. Flavigny compose les dix. Hypnotizing Fire est le versant yin du feu : baies roses, poivre de la Jamaïque et clou de girofle sur rose de Bulgarie, patchouli et praline, se posant sur vanille de Madagascar, benjoin et opoponax. La version parfum remplace l'opoponax par de l'oud.
